В 2008 году при масштабном финансировании США начались всемирные исследования по изучению генов микроорганизмов, обитающих в теле человека (микробиом), а сегодня их, микроорганизмов, известно уже несколько десятков тысяч. Родились новые термины: уробиом (совокупность генов мочевыводящих путей), виром (совокупность генов обитающих в конкретной среде вирусов), миком (совокупность генов грибов) и др. И если еще недавно пациент мог сделать в любой сетевой лаборатории или кожвендиспансере ПЦР-анализ «аж на все 12 — 16 инфекций», то сегодня это «всего лишь 12 — 16 инфекций, т.е. капля в море».
Четыре важных события, произошедшие за последние восемь лет, особенно важны для повышения эффективности лечения наших пациентов.
2017 г. — смена мировой парадигмы в лечении инфекций. Отказ от бесконтрольного применения антибиотиков. Понимание того, что микрофлора быстро приспосабливается к ним, сводя на нет интересы ведущих фармацевтических компаний по созданию новых антибиотиков (многомиллиардные затраты за несколько лет на создание одного препарата, а устойчивость формируется раньше его окупаемости). Старые препараты: цефтриаксон, азитромицин, доксициклин, ципрофлоксацин, котримоксазол и другие уже малоэффективны, а новые препараты не под силу купить ( Эртапенем — 22.000 руб на 10 дней лечения в ценах августа 2023 г., Зивокс — 29.000 руб на 10 дней, Зербакса — 178.000 руб за 30 флаконов на 10 дней лечения, а новейший цефалоспорин Фетроя (Цефидерокол) — 635.000 руб (!) за 10 ампул др.) Сегодня, например, при лечении хронического простатита лечение не начинается с антибиотикотерапии, откладывая решение вопроса о целесообразности их назначения на несколько дней.
2019 г. — смена парадигмы по отношению к половому пути передачи инфекций. Отныне любая инфекция считается способной в той или иной степени передаваться половым путём (и стафилококк, и кишечная палочка, и др.), и тогда вопрос лишь в том, насколько многочисленное вторжение происходит и насколько хватит у этой инфекции патогенных свойств, чтобы вклиниться в чужую микроэкосистему.
2019 г. — событие местного значения, но для орчан важное: началось активное внедрение Андрофлора для исследования микробиоты в диагностику генитальных инфекций. Сначала это были единицы врачей, но постепенно их число увеличивается — новое пробивает дорогу в жизнь. На очереди — исследование МИКОМА (в декабре 2024 года уже доступно в столичных клиниках за 12.000 руб), а в скором будущем есть надежда внедрить и исследование ВИРОМА.
2020 г. — наконец-то в России вышла в свет книга «Микробиом в медицине» (автор Игорь Стома, инфекционист исследователь, белорус, ученый с мировым именем, стажировавшийся на Западе). Книга получила высокую оценку рецензентов — известных ученых медиков России. И книга эта по новому заставляет взглянуть на многие вещи, взламывает многие устоявшиеся правила и принципы: это и весьма сомнительная эффективность всех так широко продаваемых в аптеках эубиотиков (пробиотиков) — каждый организм индивидуален и нуждается в определённых микроорганизмах с определенными генетическими свойствами, это и опасность для беременных пенициллиновых антибиотиков, и опасность макролидов в третьем триместре беременности (которые по прежнему активно применяются в соответствии с существующими стандартами и клиническими рекомендациями) — применение макролидных антибиотиков в третьем триместре резко повышает вероятность ожирения и бронхиальной астмы у ребенка к шестому году жизни, и другое. Выяснилось, что организм детей, играющих на улице и не моющих своевременно руки, быстрее формирует нормальный микробиом (заселяется нормофлорой). За рубежом же несколько лет кожу детей, рожденных Кесаревым сечением, сразу после родов смазывают тампоном, содержащим влагалищное содержимое матери, чтобы «заразить» нормальными микробами…
Даже сегодня, в 2025 году, исследование генитального микробиома (Андрофлор, Фемофлор) не ответило на некоторые вопросы, изучение продолжается.
1. При наличии в материале менее 100 копий ДНК возможно ошибочное невыявление микроорганизма — для уменьшения вероятности этого целесообразно проводить анализ при обострении инфекционного процесса.
2. Порой у одного пациента при одновременном заборе биоматериала на бакпосев и Андрофлор возникают противоречащие друг другу результаты. Оптимально было бы сделать оба исследования, но это повышает финансовую нагрузку на пациента.
3. Заключение робота по результату анализа формируется на основе разработок и инструкций, зачастую уже не соответствующих требованию времени. Например, игнорируется наличие условно-патогенной флоры в количестве менее 10000 / мл, хотя это количество динамично меняется и увеличивается при обострении процесса, либо ликвидации конкурентной микрофлоры. За 4 года активного использования Андрофлороа уже накоплен опыт прочтения анализа, а Заключение робота зачастую не представляет интереса.
4. Результат Андрофлора по данным соскоба с уретры далеко не всегда совпадает с результатом Андрофлора собранного эякулята. Первый предпочтителен при уретрите, но уже не так информативен при простатите и эпидидимите, а платить вдвойне вряд ли комфортно для пациента. Хотя пару лет назад ситуацию удалось «разрулить» — опытным путём было найдено решение по комбинированному забору (опытным потому, что отечественная литература крайне скудна по данному вопросу, у столичных специалистов пока нечему учиться, инструкции не разработаны).
5. Генитальный микробиом у обоих половых партнёров (супругов) в большинстве случаев не совпадает. Законы венерологии для условно-патогенной инфекции не действуют. И тогда возникает порой курьёзная ситуация, когда гинеколог присылает мужа к урологу на плановую санацию, а у мужа и близко микробный пейзаж не совпадает с таковым у партнерши, а проблемного микроба нет и в помине.
6. Исследование Вирома, Микома и Резистома в коммерческой отечественной медицине пациентам пока недоступно. Будем ожидать новых открытий и внедрений.